与此同时，朝廷局势愈发诡谲。严嵩得知萧云逃脱还搅乱江湖局势，怒不可遏，在朝堂上弹劾萧云私自离京、勾结江湖势力，意图谋反。皇帝龙颜大怒，当即派钦差前往营地，宣萧云即刻回京受审。
萧云接到旨意，眉头紧锁。林悦得知消息，心生担忧：“萧兄，你此去京城，无异于羊入虎口，严嵩定会设法置你于死地，不可莽撞行事。”萧云苦笑：“我身为臣子，君命难违，况且躲得了一时，躲不了一世。此行我也想借机揭露严嵩罪行，还朝堂清明。”
临行前，林悦塞给萧云一瓶伤药，别过头去，轻声道：“路上小心，别丢了性命，我……还等你回来一同铲除余孽。”萧云心头一暖，接过药瓶：“放心，姑娘多加保重，有事随时传信。”二人目光交汇，情愫暗流涌动，却又被现实的阴霾笼罩。
萧云随钦差回京，刚踏入京城，便感觉气氛压抑。街头百姓交头接耳，指指点点；朝堂之上，严嵩党羽虎视眈眈，等着看他笑话。皇帝高坐龙椅，面色阴沉：“萧云，你私自离京，搅乱江湖，可有话说？”萧云伏地叩首，朗声道：“陛下，臣冤枉！臣离京是为查探神秘组织，此组织与境外勾结、妄图颠覆大明，危及社稷安危。臣获知了关键线索，望陛下给臣机会，彻查到底，还臣清白。”
皇帝目光狐疑，审视许久，正要开口，严嵩上前一步，尖着嗓子道：“陛下，萧云巧言令色，分明是借机逃脱监管，与江湖匪类串通一气，图谋不轨，万不可信！”朝堂瞬间吵成一团，大臣们各执一词。
萧云心急如焚，知晓这般争论下去不是办法，突然想起带回的神秘组织信物与部分账册，忙呈上：“陛下，这些是实打实的证据，足以证明神秘组织恶行，以及背后或有朝堂之人撑腰，请陛下明察！”皇帝接过翻看，神色凝重起来。
然而，严嵩老奸巨猾，早有后手。当晚，大理寺卿突遭刺杀，证据不翼而飞，
